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| 1997年 4月 | 会社設立（株式会社ジャルエクスプレス） |
| 1998年 3月 | 機体デザイン、ロゴ、制服を発表 |
| 1998年 7月 | 運航開始 2機の737-400型機にて、 大阪国際(伊丹)−鹿児島線および伊丹−宮崎線に初就航 |
| 2000年 6月 | 搭乗旅客数が100万人を達成 |
| 2000年 12月 | 一部路線にてJAL便の受託運航を開始 |
| 2001年 3月 | 8機目の737-400型機を導入 |
| 2002年 11月 | 新しい機体デザインとロゴを発表（JALグループの統一デザイン） |
| 2005年 4月 | MD81型機を導入、順次拡大 |
| 2007年 4月 | 会社設立10周年 |
| 2008年 1月 | 新鋭機737-800型機を導入、順次拡大 |
| 2008年 7月 | JALエクスプレス就航10周年 |
| 2009年 5月 | JAL国際線受託運航を開始＜大阪(関西)-上海等＞ |
| 2010年 6月 | MD81型機退役 |
| 2011年 3月 | JAL/JAIRとの「共同引受」による運航を開始 |
| 2011年 7月 | 737-400型機退役 |
| 2011年 11月 | 本社を大阪伊丹から東京羽田へ移転 |
